增值税专用发票的认证方式主要有三种，分别是网上平台勾选认证、通过自助办税终端扫描认证和税务大厅窗口人工认证。以下是具体的认证步骤：
网上平台勾选认证
插入金税盘：
将金税盘插入电脑的USB接口，确保金税盘在闪光状态。
登录增值税发票选择确认平台：
输入税控盘证书密码登录。
发票勾选：
登录后点击“发票勾选”，选择开票日期，然后点击“查询”查看未认证的发票。
勾选发票：
选择当期需要认证的发票，点击“保存”。
确认勾选：
确认已勾选未确认的发票，点击“确认勾选”，然后点击“已勾选未确认”按钮，最后点击“确定”按钮。
打印和查看：
确认后可以打印认证明细，并通过抵扣统计模块查询当期已认证的所有发票数据。
自助办税终端扫描认证
插入金税盘：
将金税盘插入自助办税终端的USB接口。
扫描发票：
自行扫描专用发票抵扣联的票面信息，生成电子数据。
传输数据：
通过网络将生成的电子数据传输至税务机关。
获取认证结果：
税务机关完成解密和认证后，将认证结果信息返回给纳税人。
税务大厅窗口人工认证
携带资料：
携带增值税专用发票抵扣联等资料。
前往窗口：
到税务机关的申报征收窗口或自助办税机进行认证。
提交资料：
将资料提交给税务机关工作人员，由他们进行人工认证。
注意事项
勾选认证实施范围：适用于纳税人信用等级在B以上的增值税一般纳税人及营改增试点被新纳入的增值税一般纳税人。
认证时间：纳税人可以在每个税款所属当期对已勾选保存未确认的数据进行确认操作，且每期可以进行多次勾选和确认。
远程认证设备：需要纳税人自行购买扫描仪等设备，对小微企业来说可能增加一定负担。
认证结果：认证通过的发票可以作为企业抵扣的依据，未通过的发票需要仔细校对或重新扫描上传。
建议选择网上平台勾选认证，因为这种方式最为便捷，可以随时随地进行，节省时间和成本。
